Ассоциация центров коллективного пользования «Биоинженерия»

Общие сведения

Ассоциация центров коллективного пользования «Биоинженерия» создана в 2005 г. на базе ЦКП 5 организаций различной ведомственной принадлежности: Центра “Биоинженерия“ РАН, ФГУП “ГосНИИгенетика” Роснауки, Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгарда РАН, НИИ физико-химической медицины Минздравсоцразвития России, НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН. Головная организация - Центр “Биоинженерия“ РАН.

Соглашение о создании Ассоциации утверждено 15
января 2005г.

Адрес
117312, г. Москва, Проспект 60-летия Октября, д.7, к.1.

Телефон
(495)135-7319

Факс
(495)135-05-71

Email: office@biengi.ac.ru.

Руководитель Ассоциации ЦКП
академик РАСХН Скрябин Константин Георгиевич

Тематика исследований

Исследования в области генетической инженерии растений, системной биологии и биоинформатики, молекулярной микробиологии, биоинженерии антибиотиков и стероидов, биоинформатики и обеспечения биобезопасности. Медико-генетическая оценка пищевых продуктов из ГМ-источников; разработка новых алгоритмов и программного обеспечения для изучения нуклеотидных и аминокислотных последовательностей; идентификация клеточных факторов, участвующих в репродукции патогенов растений; расшифровка механизмов дифференцировки живых организмов на примере морфогенеза цветка сложноцветных; создание растений-биофабрик (получение «съедобных вакцин» в растениях).

Научные достижения за последние 3 года:
более чем на 95% расшифрована последовательность геномной ДНК фотосинтезирующей бактерии Oscillochloris trichoides. Bпервые в России прочтена первичная последовательность хлоропластной ДНК ряски Lemna minor, одного из наиболее перспективных растений для проведения генетической трансформации хлоропластов.

Методики 

Аттестованные методики:
1. Определение состава углеводов в культуральной жидкости и биологических объектах с помощью газожидкостной хроматографии (ГЖХ).
2. Определение состава углеводов в культуральной жидкости с помощью метода высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
3. Одновременное определение витаминов А, Е и каротиноидов в биологически активных добавках (БАД) методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
4. Одновременное определение витаминов В1 и В2 в биологически активных добавках (БАД) методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ)
5. Определение органических кислот в культуральной жидкости с помощью метода высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
6. Определение состава моно - и дисахаридов в культуральной жидкости и биологических объектах с помощью метода высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
7. Метод определения консервантов (бензойной и сорбиновой кислот) в биологически активных добавках (БАД) с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
8. Система методик получения биологически активных соединений, тотально меченных атомами стабильных изотопов водорода, углерода и азота, на основе использования биотехнологического потенциала  метилотрофных бактерий.
9. «Количественное определение трансгенной сои линии RR40-3-2, устойчивой к гербициду Раундап, в пищевых продуктах методом ПЦР в реальном времени с
использованием тест-системы «Центр-кит 40-3-2».
10. «Количественное определение содержания трансгенной кукурузы MON810, устойчивой к стеблевому мотыльку, в пищевых продуктах и растительном сырье методом ПЦР в режиме реального времени с использованием тест-системы «Центр-кит 810».
11. «Количественное определение содержания трансгенной кукурузы NK603, устойчивой к гербициду глифосату, в пищевых продуктах и растительном сырье методом ПЦР в режиме реального времени с использованием тест-системы «Центр-кит 603».
12. «Количественное определение содержания трансгенной кукурузы GA21, устойчивой к гербициду Раундап, в пищевых продуктах методом ПЦР в реальном времени с использованием диагностикума «Центр- кит 21».
13. МУК 2.3.2.970-00 «Медико-биологическая оценка пищевой продукции, полученной из генетически модифицированных источников» Минздрава России.
14. Национальный Стандарт Российской Федерации ГОСТ Р 52173-2003 «Сырье и продукты пищевые. Метод идентификации генетически модифицированных источников (ГМИ) растительного происхождения».
15. МУ 2.3.2.1917-04 «Порядок и организация контроля за пищевой продукцией, полученной из/или с использованием сырья растительного происхождения, имеющего генетически модифицированные аналоги» Минздрава России.

Методы, не требующие сертификации:
1. Определение состава олигонуклеотидов с помощью метода высокоэффективной жидкостной хроматографии. 
2. Анализ акриламида, акрилонитрила, акриловой кислоты методом высокоэффективной жидкостной хроматографии.
3. Определение содержания инозина в культуральной жидкости методом высокоэффективной жидкостной хроматографии.
4. Анализ содержания убихинона в культуральной жидкости методом высокоэффективной жидкостной хроматографии.
5. Методика количественного скрининга и других ферментативных активностей бактерий с применетием роботизированного комплекса.
6. Методика выделения и очистки плазмидной ДНК для секвенирования.
7. Методика очистки и подготовки фрагментов продуктов полимеразной цепной реакции к секвенированию;
8. Методика анализа нуклеотидных последовательностей GC-богатых образцов ДНК, а также образцов ДНК полученных в ходе бисульфидной конверсии.
9. Методика проведения крупномасштабного секвенирования генетических мишеней большого объема.
10. Создание ДНК-микро и -макроматриц (подбор праймеров или олигонуклеотидных зондов и их синтез; амплификация ДНК последовательностей; нанесение на мембраны полноразмерных ДНК-матриц).
11. Масс-спектрометрический анализ методом MALDI-TOF (идентификация белков по MS/MS спектрам; идентификация фосфолипидов по MS/MS спектрам).
12. Протеомные исследования (аналитический одномерный электрофорез; аналитический двумерный электрофорез; компьютерный анализ изображений; идентификация белков методом фингерпринта пептидных масс; идентификация белков с использованием алгоритмов синтеза de novo).
13. Культивирование первичных и трансформированных культур клеток млекопитающих, а также культивирование микроорганизмов. 
14. Цитотоксические тесты (оценка пролиферации клеток; оценка выживаемости клеток; оценка апоптогенного действия веществ; оценка редокс-статуса клеток).
15. Прямое белковое профилирование бактерий с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии.

Оборудование 

1. Автоматический секвенатор ABI 3730 (Applied Biosystems, США) – 2004 г. выпуска, стоимость – 7550000 руб.
2. Роботизированный комплекс для изготовления AFM полей “Nanoarrayer IV” (BioForse Nanosciens, Inc, США) – 2006 г. выпуска, стоимость – 8991776 руб.
3. Чип-сканер Typhoon (GE Healthcare, Германия) – 2005 г. выпуска, стоимость – 5868349 руб.
4. ДНК-амплификатор Dual 96 (Applied Biosystems, США) – 2004 г. выпуска, стоимость – 412000 руб.
5. ДНК-амплификатор для проведения ПЦР в реальном времени ABI 7000 (Applied Biosystems, США) – 2003 г. выпуска, стоимость – 1736000 руб.
6. Робот для культуральных операций QP Display C с запасным держателем плашек (Genetix Lmd, Англия) – 2006 г. выпуска, стоимость – 7435703 руб.
7. Cинтезатор ДНК ASM-700 Биоссет (НПО «Вектор», Россия) – 2003 г. выпуска, стоимость – 660000 руб.
8. Автоматический секвенатор Avant 3100 (Applied Biosystems, США) – 2003 г. выпуска, стоимость – 4500000 руб.
9. Cистема EXQuest sport cutter (Bio-Rad, США) – 2005 г. Выпуска, стоимость – 3369627 руб. 
10. Ультра центрифуга Optima L-90 K в комплекте с роторами: Type 42.2 Ti Type 25 (Beckman Coulter, Inc, США) – 2005 г. выпуска, стоимость – 3830518 руб.
11. ДНК-амплификатор Parallab (Parallabs, Англия) – 2006 г. выпуска, стоимость – 10007577 руб.
12. Центрифуга Optima Max (Beckman Coulter, Inc, США) – 2006 г. выпуска, стоимость – 3037616 руб.
13. Прибор автоматической подготовки проб ABI6700 (Applied Biosystems, США) – 2001 г. выпуска, стоимость – 400000 руб.
14. Ферментер Biostal C-30-DCU-3 в комплекте, (Sartorius, Германия) – 2006 г. выпуска, стоимость – 6183828 руб.
15. Проточный цитометр EPICS XL 4 (Beckman Coulter, Inc, США) – 2005 г. выпуска, стоимость – 4071500 руб.
16. Хроматограф Waters (Waters Corporation, США) – 2003 г. выпуска, стоимость – 3000000 руб.