Фолдинг

Фолдинг (англ. Folding)- это процесс принятия молекулами определенной формы или конформации. Наиболее активно изучается фолдинг белков, которые образуют третичную структуру за счет специфической последовательности аминокислот, имеющих определенные химические свойства. При взаимодействии аминокислот друг с другом и клеточным окружением получается хорошо определённая трёхмерная структура — конформация. В результате на внешней поверхности белковой глобулы формируются полости активных центров, а также места контактов субъединиц мультимерных белков друг с другом и с биологическими мембранами. Форма молекулы белка обуславливает его функции и может быть использована для разработки лекарственных средств, влияющих на различные процессы в организме. В некоторых случаях возможно существование двух правильных конформаций белка (конформеров), выполняющих различные функции, и имеющих примерно равные по энергии состояния в разных областях фазового пространства белковой молекулы. Образование правильной трехмерной структуры белка крайне важно для его корректной работы, так как нарушения в свертывании приводят к образованию неактивной молекулы с новыми свойствами. Фолдинг также имеет большое значение при синтезе новых молекул или фолдамеров. Они могут служить моделями биологических молекул и потенциально могут быть использованы при разработке новых функциональных наноматериалов.

Схема процесса фолдинга

Тезаурус

Фолдинг (Folding)

Тематический раздел (поле): Наномедицина, Нанофармакология, Нанотехнологии для сельского хозяйства, Функциональные наноматериалы

Функциональный разряд: Действие (операция)

Аскрипторы: Фолдинг белка, укладка белка

Отношения иерархические (род-вид): Фолдинг→ Методы, основанные на специфических свойствах биологических молекул → Методы нанесения элементов наноструктур и наноматериалов → Получение, диагностика и сертификация наноразмерных систем → Нанотехнологии

Отношения ассоциативные: Фолдинг ~ Посттрансляционная модификация, Белки-шапероны, Протеолитическая деградация, Белки теплового шока, Фолдазы, Изомеразы, Молтен-глобула, Котрансляционный фолдинг, Фолдазы, Парадокс Левинталя, Белки-шапероны, Шапероновая система

Литература по теме

1. Levinthal C. (1968). Are there pathways for protein folding. J. Chim. Phys. 65, 44–45.
2. Dill K.A., Ozkan S.B., Weikl T.R., Chodera J.D., Voelz V.A. (2007). The protein folding problem: when will it be solved? Curr. Opin. Struct. Biol. 17, 342–346.
3. Hill DJ, Mio MJ, Prince RB, Hughes TS, Moore JS (2001). "A field guide to foldamers". Chem. Rev. 101 (12): 3893–4012.
4. Zagrovic B., Snow C.D., Shirts M.R., Pande V.S. (2002). Simulation of folding of a small alpha-helical protein in atomistic detail using worldwide-distributed computing. J. Mol. Biol. 323, 927–937.
5. Статья Protein folding из Wikipedia, свободной энциклопедии. Доступно под лицензией Creative Commons Attribution-Share Alike.
6. Статья Фолдинг белка из Wikipedia, свободной энциклопедии. Доступно под лицензией Creative Commons Attribution-Share Alike.