Метаболомика

Метаболомика (англ. Metabolomics) - это область науки, изучающая метаболические интермедиаты (и их концентрации), которые, в свою очередь, являются предшественниками всех клеточных компонентов. Метаболом представляет собой совокупность всех метаболитов, являющихся конечным продуктом обмена веществ в клетке, ткани, органе или организме. В то время как данные об экспрессии мРНК генов и данные протеомного анализа не раскрывают полностью всего того, что может происходить в клетке, метаболические профили могут дать мгновенный снимок физиологических процессов в клетке. Целью работы по определению концентраций интермедиатов метаболизма является воссоздание общей картины распределения потоков атомов исходных субстратов в продукты жизнедеятельности клеток. Сложности исследований в области метаболомики обусловлены тем, что с химической точки зрения многие интермедиаты метаболизма очень похожи, потому их сложно отделить друг от друга стандартными физико-химическими методами. Однако в метаболизме эти похожие соединения, как правило, не путаются ферментами и могут иметь различное значение для всей жизнедеятельности клетки. Еще одна принципиальная проблема метаболомики связана с тем, что время жизни многих метаболических интермедиатов в клетке очень мало (они химически нестабильны в клеточных экстрактах), а их содержание в клетке очень сильно зависит от «условий жизни» организма.

Тезаурус

Метаболомика (Metabolomics)

Тематический раздел (поле): Нанобиотехнологии, Наноинженерия, Нанотехнологии для безопасности, Диагностика наноразмерных систем

Функциональный разряд: Научная область

Аскрипторы: Биоинформатика, биоинженерия, метабономика, функциональная геномика

Отношения иерархические (род-вид): Метаболомика → Нанобиотехнологии → Нанотехнологии и наноматериалы 

Отношения ассоциативные: Метаболомика ~ Нарушения метаболизма, Токсигеномика, Фармакогеномика, Нутриномика, Биохимические реакции, Метаболиты, Молекулярная медицина, Ферменты метаболизма, Масс-спектрометрия, Метаболом, Профили метаболитов, Метаболический фингерпринтинг

Литература по теме

1. Beecher C.W.W. (2003) In: Metabolic profiling: Its role in biomarker discovery and gene function analysis (G.George and RG.Harrigan eds.) Springer, New York, pp. 311-335.
2. Weckwerth W. (2003) Annu. Rev. Plant. Biol., 54, 669–689.
3. Dettmer K., Hammock B.D. (2004) Environ. Health Perspect., 112, 396–397.
4. Novotny et al J Chromatog B (2008) 866:26-47
5. Griffiths, W.J. and Wang, Y. (2009) Chem Soc Rev 38:1882-96
6. Morrow Jr., Ph.D., K. John (1 April 2010). "Mass Spec Central to Metabolomics". Genetic Engineering & Biotechnology News 30 (7): p. 1. Archived from the original on 28 June 2010.
7. Crockford DJ, Maher AD, Ahmadi KR, et al. (September 2008). "1H NMR and UPLC-MS(E) statistical heterospectroscopy: characterization of drug metabolites (xenometabolome) in epidemiological studies". Anal. Chem. 80 (18): 6835–44.
8. Машко С.В. и др. Использование метаболической регуляции для оптимизации экспрессии генов – новое направление развитие биотехнологии XXI века. // Биотехнология №4 –2002. – С. 3-14.
9. Meynial-Salles, I., Cervin, M.A., Soucaille, P. “New Tool for Metabolic Pathway Engineering in Escherichia coli: One-Step Method To Modulate Expression of Chromosomal Genes”. // Appl. & Enviroment. Microbiol. 71 – 2005. – 2140-2144.
10. Bongaerts, J., Krämer, M., Müller, U., Raeven, L., Wubbolts, M. “Metabolic Engineering for Microbial Production of Aromatic Amino Acids and Derived Compounds” – Minireview. // Metabolic Engineering 3 – 2001. – Р. 289-300.
11. Лохов П.Г., Арчаков А.И. Масс-спектрометрические методы в метаболомике // Биомедицинская Химия, 2008 том 54, вып. 5, с. 497-511.
12. Статья Metabolomics из Wikipedia, свободной энциклопедии. Доступно под лицензией Creative Commons Attribution-Share Alike
13. Статья Метаболомика из Wikipedia, свободной энциклопедии. Доступно под лицензией Creative Commons Attribution-Share Alike