Протеомика

Протеомика (англ. Proteomics)- область науки, изучающая белки и их взаимодействия в живых организмах. Изучается синтез белков, их декомпозиция и функции в организме или системе. Термин «Протеомика» впервые был использован Марком Уилкинсом (Marc Wilkins) в 1994 году при подготовке своей диссертации и является производным от слов протеин и геном. Протеомом называется совокупность белков, включающая их модификации, создаваемые организмом или системой. Протеомика позволяет разделить и визуализовать (с помощью двумерного электрофореза с последующим окрашиванием полипептидов) большую часть клеточных белков, синтезированных в определенных условиях роста организма. При этом количественно детектируются изменения эффективности образования белков при различном составе питательной среды, введении мутаций по генам, кодирующим ферменты метаболизма и т.п. Изучаемые зоны белков вырезаются, и соответствующие белки, а также продукты их последующего расщепления, анализируются с помощью методов масс-спектрометрии. В результате молекулярная масса анализируемого белка (и продуктов его расщепления) определяется с высокой точностью. В настоящий момент созданы базы данных о структуре всех белков человека, а также их протеолитических фрагментов, полученных в стандартных условиях. Это позволяет идентифицировать белки по молекулярной массе их протеолитических фрагментов, полученных в тех же условиях.

Тезаурус

Протеомика (Proteomics)

Тематический раздел (поле): Нанобиотехнологии; Наноинженерия

Функциональный разряд: Научная область

Аскрипторы: Биоинформатика, биоинженерия, функциональная протеомика, фосфопротеомика

Отношения иерархические (род-вид): Протеомика → Нанобиотехнологии → Нанотехнологии и наноматериалы

Отношения ассоциативные: Протеомика ~ Структура белка, Аминокислоты, Фолдинг белка, Третичная структура белка, Функциональная протеомика, Геномика, Биоинформатика, Фосфопротеомика, Методы исследования белков, Биомаркеры, Протеом

Литература по теме

1. Anderson NL, Anderson NG (1998). "Proteome and proteomics: new technologies, new concepts, and new words". Electrophoresis 19 (11): 1853–61.
2. Blackstock WP, Weir MP (1999). "Proteomics: quantitative and physical mapping of cellular proteins". Trends Biotechnol. 17 (3): 121–7.
3. Wilkins MR, Williams KL, Appel RD, Hochstrasser DF (1997). Proteome Research: New Frontiers in Functional Genomics (Principles and Practice). Berlin: Springer.
4. Simon Rogers, Mark Girolami, Walter Kolch, Katrina M. Waters, Tao Liu, Brian Thrall and H. Steven Wiley (2008). "Investigating the correspondence between transcriptomic and proteomic expression profiles using coupled cluster models". Bioinformatics 24 (24): 2894–2900.
5. Vikas Dhingraa, Mukta Gupta, Tracy Andacht and Zhen F. Fu (2005). "New frontiers in proteomics research: A perspective". International Journal of Pharmaceutics 299 (1–2): 1–18.
6. Rzhevsky D.I., Zhokhov S.S., Babichenko I.I., Goleva A.V., Goncharenko E.N., Baizhumanov A.A., Murashev A.N., Lipkin V.M., Kostanyan I.A. (2005). HLDF-6 peptide affects behavioral reactions and organism functions dependent on androgen hormones in normal and castrated male mice. Regul. Pept. 127 (1-3), 111–21.
7. Archana Belle, Amos Tanay, Ledion Bitincka, Ron Shamir and Erin K. O’Shea (2006). "Quantification of protein half-lives in the budding yeast proteome". PNAS 103 (35): 13004–13009.
8. Арчаков А. И. Что за геномикой? – Протеомика. //Вопр. мед. химии, 2000. Т. 46, № 4. С. 335–343.
9. Замятнин А.А. Блистающий мир белков и пептидов. //Биология. 2002. № 25–26. P. 8–13.
10. Статья Proteomics из Wikipedia , свободной энциклопедии. Доступно под лицензией Creative Commons Attribution-Share Alike